Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms