Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms