Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4CQ9HCJ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms