Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms