Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC4Q9HBW1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 528.3 ms