Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF2Q9HAU5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms