Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF2Q9HAK2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms