Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms