Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R7

WDCP, WD repeat and coiled-coil-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDCPQ9H6R7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDCPQ9H6R7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDCPQ9H6R7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
WDCPQ9H6R7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
WDCPQ9H6R7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
WDCPQ9H6R7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDCPQ9H6R7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDCPQ9H6R7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms