Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S3

TMPRSS5, Transmembrane protease serine 5, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS5Q9H3S3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMPRSS5Q9H3S3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPRSS5Q9H3S3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPRSS5Q9H3S3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPRSS5Q9H3S3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPRSS5Q9H3S3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPRSS5Q9H3S3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS5Q9H3S3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS5Q9H3S3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS5Q9H3S3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS5Q9H3S3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS5Q9H3S3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms