Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRDQ9H2X0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRDQ9H2X0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRDQ9H2X0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms