Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GANQ9H2C0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms