Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC39A8Q9C0K1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms