Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms