Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A5Q9BY07 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms