Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC94Q9BW85 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms