Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms