Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3CQ9BUI4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms