Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFJQ9BTM1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms