Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms