Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTA3Q9BTC8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms