Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2Q9BSQ5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms