Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD2Q9BSE4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms