Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms