Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSG101Q99816 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms