Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms