Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms