Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms