Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms