Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC114Q96M63 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms