Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms