Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms