Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87BQ96K49 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms