Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A4AQ96JQ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms