Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG3Q96JB2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms