Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms