Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms