Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms