Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMA16Q96EY4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMA16Q96EY4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms