Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNFT2Q96EX2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNFT2Q96EX2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms