Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPDL1Q96EA4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms