Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPACA9Q96E40 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms