Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM44Q96DX7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms