Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A6EQ96DS6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms