Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD4Q96DM1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms