Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms