Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUNDC1Q96C34 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms