Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC8Q96B26 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC8Q96B26 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms