Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms