Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP13Q92995 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP13Q92995 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP13Q92995 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP13Q92995 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP13Q92995 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP13Q92995 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP13Q92995 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP13Q92995 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP13Q92995 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP13Q92995 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP13Q92995 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP13Q92995 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP13Q92995 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP13Q92995 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP13Q92995 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP13Q92995 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP13Q92995 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP13Q92995 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP13Q92995 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP13Q92995 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP13Q92995 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP13Q92995 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP13Q92995 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP13Q92995 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP13Q92995 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP13Q92995 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP13Q92995 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP13Q92995 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP13Q92995 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP13Q92995 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP13Q92995 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP13Q92995 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP13Q92995 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP13Q92995 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP13Q92995 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP13Q92995 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP13Q92995 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP13Q92995 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP13Q92995 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP13Q92995 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP13Q92995 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP13Q92995 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP13Q92995 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP13Q92995 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP13Q92995 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP13Q92995 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP13Q92995 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms